Factura electrónica: preguntas y respuestas sobre los cambios de noviembre 2026

A partir del primero de noviembre del 2026 los comprobantes electrónicos deberán incluir varias modificaciones obligatorias establecidas por el Ministerio de Hacienda. Dentro de las principales preguntas y respuestas relacionadas con este tema, se encuentran las siguientes:

• Con los cambios en los comprobantes electrónicos, ¿se deben rectificar las declaraciones de IVA siempre que se emita una Nota de Crédito Electrónica?

R/ No. Si bien es cierto la nueva versión de comprobantes electrónicos incluye códigos de referencia específicos que involucran, de forma inherente, la rectificación de declaraciones de IVA, no es en todos los casos que debe realizarse dicha rectificación. Como regla general, se deberá rectificar un periodo anterior únicamente cuando exista un error en los montos declarados o un error de clasificación en las casillas utilizadas dentro del formulario.

Las Notas de Crédito Electrónicas que se emitan por descuentos, por devoluciones de mercadería y/o por otras prácticas comerciales del giro de negocio, normalmente no deberían involucrar la rectificación de declaraciones de impuestos.

• ¿Cuál es la diferencia entre el código de referencia 01 “Anula Documento de Referencia” y el nuevo código 13 “Anula documento de referencia por error material”?

R/ Cuando se emite un comprobante electrónico, uno de los rubros obligatorios que debe incluir dicho comprobante es el código de referencia. En este sentido, con la nueva versión de comprobantes electrónicos vigente a partir del 1° de noviembre del 2026, se incluye un nuevo código 13 denominado “Anula documento de referencia por error material”, no obstante, se mantiene vigente el código 01 “Anula Documento de Referencia”, por lo cual surge la interrogante de cuándo se debe utilizar cada uno de ellos.

Al respecto, el código 13 debe utilizarse cuando una Factura Electrónica emitida en meses anteriores poseía un error, y por ende es necesario anularla, para lo cual se emitirá una Nota de Crédito Electrónica en el mes actual utilizando dicho código 13. Por otro lado, el código 01 se debe utilizar cuando se emite una Nota de Crédito Electrónica para anular una factura electrónica emitida dentro del mismo mes en el que se emite dicha nota de crédito.

A manera de ejemplo, imaginemos que en noviembre del 2026 se identifica que una Factura Electrónica emitida en el mes de mayo del 2026 indicaba una venta de 10 mil dólares, pero en realidad correspondía a una venta de 10 mil colones. Para corregir este error, deberá anularse la factura original con una Nota de Crédito Electrónica utilizando el código 13, y se deberá emitir la Factura Electrónica correcta de 10 mil colones utilizando el código de referencia 15 (también un código nuevo) que se denomina “Sustituye comprobante electrónico por error material”.

Ahora bien, imaginemos el mismo escenario anterior, solamente que en lugar de haber emitido la factura original en el mes de mayo del 2026, se emitió la primera semana de noviembre y que es a finales de ese mismo mes de noviembre que se identifica el error. En este caso la forma de corregirlo sería emitir una Nota de Crédito Electrónica con el código 01 y proceder a emitir una nueva Factura Electrónica utilizando el código 07 “Sustituye comprobante electrónico”.

Conviene también recordar que, para errores que no requieran la anulación completa de la Factura Electrónica, sino solo una corrección en su monto, se incluye también el nuevo código 14 “Corrige monto por error material”, el cual tiene la misma lógica y debe utilizarse en las Notas de Crédito o Débito Electrónicas, con la diferencia que no sería necesario emitir una nueva Factura Electrónica.

• Si ocurre un rechazo de comprobante electrónico por parte del Ministerio de Hacienda, ¿se debe anular dicho comprobante emitiendo una Nota de Crédito Electrónica?

R/ No. Cuando un comprobante electrónico es rechazado por parte del Ministerio de Hacienda, dicho comprobante carece de validez por lo cual no es necesario emitir una Nota de Crédito Electrónica para su anulación. No obstante, la nueva versión de comprobantes electrónicos sí cuenta con el código de referencia 16 denominado “Sustituye comprobante electrónico rechazado”, el cual deberá incluirse en la Factura Electrónica que se emita como reemplazo del comprobante rechazado.

• ¿Se va a permitir en los comprobantes electrónicos incluir cédulas alfanuméricas?

R/ Correcto. De acuerdo con las disposiciones del Registro Nacional, las sociedades podrán contar con números de cédula jurídica que incluyan caracteres alfanuméricos, por lo cual la nueva versión de comprobantes electrónicos contempla esta posibilidad, de manera que el comprobante no será rechazado cuando la identificación del receptor o emisor sea alfanumérica.

• Con la nueva versión de comprobantes electrónicos, ¿será posible anular una Factura Electrónica de Exportación utilizando una Nota de Crédito Electrónica?

R/ Sí. La nueva versión de comprobantes electrónicos incluye un nuevo tipo de documento de referencia con el código 19 denominado “Factura Electrónica de Exportación”, por lo cual será posible que una Nota de Crédito Electrónica haga referencia específica a una Factura Electrónica de Exportación.

• Si tengo un sistema de facturación propio, ¿debo realizar las parametrizaciones del sistema para incluir todos los códigos nuevos?

R/ Sí. Todo sistema de facturación electrónica debe permitir la aplicación de las nuevas disposiciones establecidas por el Ministerio de Hacienda.

Por último, es importante mencionar que, según lo indicado por el Ministerio de Hacienda, estos cambios en los comprobantes facilitarán el proceso de “prellenado” de las declaraciones de impuestos, por lo cual su implementación y uso correcto, además de ser obligatorio, se vuelve fundamental para que los contribuyentes declaren su información de forma correcta y así evitar sanciones y recargos tributarios. Se recomienda a los contribuyentes verificar con sus proveedores de facturación electrónica la correcta implementación de estos cambios y velar porque sus efectos sean contabilizados y declarados en los periodos correspondientes.